El Protocolo establece las normas mínimas para llevar a cabo un proceso de consulta libre, previa e informada a las comunidades de Oaxaca y Veracruz en relación con el contenido del “Programa de Desarrollo del Istmo de Tehuantepec”, a fin de que sean incorporadas en su concepción, diseño e implementación, garantizando el desarrollo integral, intercultural y sostenible de dichos pueblos. Asimismo, se busca establecer acuerdos con los pueblos y comunidades indígenas que se encuentren en el área de influencia del proyecto respecto de su participación en la implementación del Programa, así como la distribución justa y equitativa de los beneficios.